クイーンズ区に位置し、マンハッタンの南東約16マイル（26km）にあるジョン・F・ケネディ国際空港（JFK）は、1948年から運営されている。1963年のジョン・F・ケネディ暗殺後、空港は殺害された第35代アメリカ合衆国大統領にちなんで改名された。
空港はジャマイカ湾の湿地帯だった場所に建設され、一時はアイドルワイルド・ゴルフコースも含まれていた。1948年に正式にニューヨーク国際空港アンダーソン・フィールドと命名されたが、新しい空港は一般的にアイドルワイルドと呼ばれ、1963年後半まで一般的に使われた。
正式な開港式にはハリー・S・トルーマン大統領が出席し、1948年7月1日に初飛行が行われた。新空港の成長と発展を促進するため、港湾局は、当時需要への対応に苦慮していた近隣のラガーディア空港への着陸許可を取り消し、外国の航空会社にアイドルワイルドの利用を強制した。開港当時、アイドルワイルドには小さなターミナルビルが1棟あったが、1952年に管制塔が増設され、多数の新しい建物や滑走路も建設されたため、2、3年のうちに3倍近い広さに拡張された。
1951年、JFK国際空港の平均発着便数はわずか73便だったが、翌年ニューアーク空港が一時閉鎖され、アイドゥルワイルド空港に便が移ったため、この便数は劇的に増加した。新型機DC-7やL-1049コンステレーションが登場し、ラ・ガーディアよりもアイドルワイルドを優先的に利用するようになったことで、空港はさらなる発展を遂げた。1957年半ばには、1週間の平均出発回数が1,280回を超えるまでになった。
わずか数年で、アイドルワイルドは世界で最も忙しい空港のひとつとなり、1954年には国際航空輸送量で世界一を記録した。当初は55のゲートを備えた単一ターミナルとして構想されていたが、すぐに現実的ではなく、需要に対して不十分であると判断され、主要航空会社は利用可能なスペースでは将来の成長に対応できないと抗議した。
1955年、7つの新ターミナルの建設計画が発表され、そのうち5つは各航空会社の最大手に割り当てられ、1つは他の航空会社3社と共用、1つは国際線到着専用に指定された。さらに、11階建ての管制塔が新設され、新しく拡張された空港の円滑な運営に必要な道路、誘導路、駐車場も建設される予定だった。
1963年12月のケネディ大統領暗殺の1ヵ月後、空港は正式にジョン・F・ケネディ国際空港と命名され、JFKとKJFKという新しい航空会社コードが与えられた。
1963年から2016年まで、JFK空港はさらなる拡張とアップグレードを繰り返してきたが、2017年1月、アクセスに対する需要が増え続け、容量が不足していることから、空港の大規模改修が必要であると判断された。当時、JFK空港は年間約6,000万人の旅客を受け入れていたが、2020年には7,500万人に増加し、2050年には1億人を超えると予想されている。計画された改修は以下の通り：
最終的に改修が完了すると、JFK空港は航空機がアクセスできる149のゲートと4本の滑走路を持つことになる。
JFK空港には現在、1から8までの6つのターミナルがあり、例外としてターミナル3と6はそれぞれ2011年と2013年に取り壊され、ターミナル5はその2つの代わりに大幅に拡張された。
ターミナル1には以下の航空会社が乗り入れている：アエロフロート航空、中国国際航空、エールフランス航空、エールセルビア航空、セネガル航空、アシアナ航空、オーストリア航空、アゼルバイジャン航空、アゾレス航空、ブリュッセル航空、ケイマン航空、中国東方航空、コンドール航空、イースタン航空、エジプト航空、エバー航空、フレア航空、インタージェット、ITA航空、日本航空、大韓航空、ルフトハンザ ドイツ航空、NEOS、ノルウェー・アトランティック航空、フィリピン航空、ロイヤル・エア・モロッコ、サウジアラビア航空、スイスインターナショナルエアラインズ、スウープ、TAPポルトガル航空、トルコ航空、ビバアエロバス、ボラリス。
ターミナル2はデルタ航空専用です。
ターミナル4は国際線到着用で、デルタ航空の長距離便のハブでもあります。就航している航空会社は以下の通り：アエロ・メヒコ航空、エア・ヨーロッパ、エア・インディア、アビアンカ・ブラジル航空、カリビアン航空、チャイナエアライン、中国南方航空、コパ航空、デルタ航空、エル・アル航空、エミレーツ航空、エティハド航空、ハワイアン航空、ケニア航空、KLMオランダ航空、クウェート航空、ラタム航空、シンガポール航空、南アフリカ航空、ウズベキスタン航空、ヴァージン・アトランティック航空、ウェストジェット航空、アモイ航空。
ターミナル5は主に格安航空会社のジェットブルー航空が使用するが、アイルランドの航空会社エアリンガスのフライトも取り扱っている。
ターミナル7は現在ブリティッシュ・エアウェイズが運営しており、2022年まで同社がリースしている。ブリティッシュ・エアウェイズのフライトだけがターミナル7を使用しているわけではない：アエロリニアス・アルヘンティーナス航空、アラスカ航空、ANA（全日空）、ユーロウィングス、イベリア航空、アイスランド航空、LOT航空、ウクライナ国際航空、ユナイテッド航空も使用している。
JFK空港で3番目に大きな航空会社であるアメリカン航空が管理するターミナル8は、以下の航空会社の発着センターでもあります：キャセイパシフィック航空、エチオピア航空、フィンランド航空、カタール航空、ロイヤル・ヨルダン航空の発着センターでもあります。
JFK空港の全ターミナルはエアトレイン・ネットワークで結ばれている。各ターミナルの短期駐車場脇にはエアトレインの駅があり、24時間365日、2～5分間隔で運行している。エアトレイン・サービスは駐車場、レンタカー施設、ホテル・シャッフルにも接続しており、無料でご利用いただけます。
入国する外国人旅行者の大半はターミナル4から米国に入国し、入国審査を受けます。入国審査は、どのターミナルに到着する航空機が処理されるかにかかわらず、同じ手順で行われます。APC（自動パスポートコントロール）キオスクまたはモバイルパスポートコントロールアプリを使用できる米国市民またはカナダ市民（またはグローバルエントリープログラムに登録した国からの旅行者）を除き、すべての到着旅客は米国市民以外のパスポートコントロールに出頭して手続きを行う必要があります。
米国に入国する外国籍の方は、ESTAの承認を受けた有効なパスポートが必要です。ESTA（Electronic System for Travel Authorization：電子渡航認証システム）は、ビザ免除プログラムであり、米国を訪れるすべての外国人に義務付けられています。この判断は最終的に米国税関国境警備局（CBP）の係官に委ねられるため、ESTAが承認したパスポートを所持しているからといって、自動的に米国への入国が保証されるわけではないことに注意してください。
出国審査では、米国訪問の目的、滞在先や訪問先に関する詳細を尋ねられることがあります。場合によっては、セキュリティ・プロトコルの一環として、写真撮影や指紋の提出を求められることもあります。また、食べ物や植物には虫や病原菌、病気が含まれている可能性があるため、申告することが求められます。
JFK空港とニューヨーク市内間の移動は、空港からニューヨーク市内まで運行しているエアトレインを利用するのが一番でしょう。JFK空港へ向かう乗客、またはニューヨーク市内に到着した乗客には、さまざまなオプションがあります。
エアトレインはJFK空港の全ターミナルを結ぶだけでなく、ジャマイカ駅またはハワードビーチ駅を終点として市内へも運行しています。ジャマイカ駅からは地下鉄に乗り継ぎ、クイーンズ、ブルックリン、ミッドタウン、ロウアーマンハッタン、ジャマイカセンターへ行くことができる。ロングアイランド鉄道もジャマイカ駅にあり、クイーンズ、ブルックリン、マンハッタンからロングアイランドまで走っている。ハワード・ビーチ駅は地下鉄と接続しており、東のブルックリンとマンハッタンからJFK空港の南、ロッカウェイズまで走っている。
ニューヨークの地下鉄はJFK空港まで運行していないため、旅行者はまずジャマイカ駅またはハワードビーチ駅に到着し、空港の全ターミナルに乗り入れているエアトレインに乗り換える必要があります。
メトロポリタン・トランスポーテーション・オーソリティ（MTA）は、ブルックリン、クイーンズ、およびその他のニューヨーク地区からジョン・F・ケネディ国際空港行きの定期バスを運行しています。
出発地（または目的地）によっては、JFK空港からのタクシーは高額になる場合があります。マンハッタンからJFK空港までは、1～4人乗り（ミニバンでは5人乗り）一律料金$52（現在）を利用することができます。この定額料金には、ピーク時の割増料金と50セントの州税がかかる場合がある。また、運転手にはチップを払う習慣がある。
JFK空港の各到着ターミナルには、レンタカー会社のカウンターか、レンタカー会社に連絡できる送迎電話があるので、到着した旅行者は簡単にレンタカーを借りることができる。
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